Da die Angabe dieser Datei im Entwicklungssystem erfolgt und daher in Deinem Makefile nicht auftaucht kann es schon sein das daher die Fehler kommen.
wx-config --cxxflags im GNUmakefile liefert die notwendigen #include-Pfade ... und wx/wx.h wird ja in main.cpp eingebunden. Der Patch verändert da nichts ... es fehlen nur ein paar Standard-"Header" für C++, wie z.B. cstdarg und cstring ...